1.  Monoklonális antitestek előállítása kutatási és diagnosztikus célokra (Dr. Németh Péter)

2. Konzervatív antigének immunológiai felismerése és szerepük tanulmányozása az aktív tolerancia kialakulásában, a fiziológiás és a kóros autoimmunitásban. Mitokondriális belső membrán enzimekkel (citrát-szintáz, malát-dehidrogenáz, piruvát-dekarboxiláz) reagáló autoantitestek térképezése immunológiai és molekuláris biológiai módszerekkel. (Dr. Németh Péter Dr. Czömpöly Tamás)

3. B-sejt fejlõdés és regulációja, egér lép funkcionális morfológiai vizsgálata (Dr. Balogh Péter, Dr. Lábadi Árpád)

4. CD45 izoformák vizsgálata (Dr. Balogh Péter, Dr. Lábadi Árpád)

5. A veleszületett immunitás sejtes illetve humorális elemeinek vizsgálata gerinctelen állat modellekben (Dr. Németh Péter Dr. Engelmann Péter, Opper Balázs, Bovári Judit)

6. Glukokortikosteroidok szerepe a T-sejt fejlõdés szabályozásában TcR transzgenikus és Balb/c egér modellben (Dr. Berki Timea)

7. Glukokortikosteroidok által illetve TcR-en keresztül indukálható apoptosis útvonalak a thymocyta differenciáció során (Dr. Berki Timea, Dr. Boldizsár Ferenc, Dr. Bartis Domokos, Dr. Pálinkás László)

8. T-sejt jelátvitel, különös tekintettel a glukokortikosteroidok módosító szerepére (Dr. Boldizsár Ferenc, Dr. Bartis Domokos)

9. Módszertani fejlesztés a mikrobead alapú flow citometriás citokin mintázat és autoantitest meghatározásra (Dr. Berki Timea, Dr. Pálinkás László)

10. Fág könyvtárak kialakítása immunológiai kölcsönhatésok vizsgálatára (Dr. Czömpöly Tamás)

11. Lentivirális vektorok készítése és alkalmazása (Dr Kvell Krisztián)

12. Timusz fejlődése, különös tekintettel a Wnt és PKC jeltovábbításra (Dr. Pongrácz Judit, Miskei György Zsolt, Varecza Zoltán, Dr. Kvell Krisztián)